Tham gia lần đầu

•  Sierra Leone

Trở lại

Chỉ định

•  Nigeria – Unoaku Anyadike là MBGN 2015 (Cô gái đẹp nhất Nigeria 2015) được Silverbird Group, nhà phát hành giấy phép của Hoa hậu Hoàn vũ ở Nigeria chỉ định tham gia Hoa hậu Hoàn vũ 2016 sau khi cuộc thi MBGN 2016 đã bị huỷ bỏ do cuộc suy thoái kinh tế đang cản trở quốc gia. Anyadike đã đăng quang MBGN 2015 và tham gia Hoa hậu Thế giới 2015.
•  Panama – Keity Drennan được chỉ định là "Hoa hậu Hoàn vũ Panama 2016" tại một buổi lễ do Justine Pasek và Cesar Anel Rodríguez, giám đốc quốc gia của cuộc thi Señorita Panamá, sau khi họ được chỉ định làm chủ nhượng quyền thương mại mới cho Hoa hậu Hoàn vũ Panama. Trước đây, Tổng công ty Medcom, dưới sự chỉ đạo của Marisela Moreno, đã tổ chức nhượng quyền thương mại cho Hoa hậu Hoàn vũ ở Panama.
•  Romania – Teodora Dan được chỉ định làm "Hoa hậu Hoàn vũ Romania 2016" sau khi một cuộc tuyển chọn đã được tổ chức bởi giám đốc quốc gia Ernest Hadrian Böhm, người đã nhận được giấy phép nhượng quyền thương mại của Hoa hậu Hoàn vũ ở Romania[46].
•  Thụy Sĩ – Dijana Cvijetić được chỉ định làm "Hoa hậu Hoàn vũ Thụy Sĩ 2016" bởi Veeranda Aeberli, giám đốc quốc gia mới của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Thụy Sĩ, vì thiếu thời gian để tổ chức cuộc thi quốc gia. Trước đây, François Matthey đã tổ chức nhượng quyền thương mại cho Hoa hậu Hoàn vũ ở Thụy Sĩ.
•  Quần đảo Virgin (Mỹ) – Carolyn Carter được chỉ định là "Hoa hậu Hoàn vũ Quần đảo Virgin (Mỹ)" 2016 bởi Tom Youth, giám đốc quốc gia của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Quần đảo Virgin (Mỹ).
•  Việt Nam – Đặng Thị Lệ Hằng được chỉ định làm "Hoa hậu Hoàn vũ Việt Nam 2016" bởi Tony Nguyễn Quốc Toản, giám đốc quốc gia của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Việt Nam. Cô là Á hậu 2 trong cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Việt Nam 2015.

Thay thế

•  Bỉ – Stephanie Geldhof được chỉ định tham gia cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ 2016 bởi Darline Devos, chủ tịch của cuộc thi Hoa hậu Bỉ, thay thế cho Lenty Frans, Hoa hậu Bỉ 2016. Lenty Frans chỉ tham dự cuộc thi Hoa hậu Thế giới năm 2016 do lịch tổ chức Hoa hậu Bỉ 2017 diễn ra vào đầu tháng 1 năm 2017 bị trùng với lịch của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ 2016. Geldhof là Á hậu 1 tại cuộc thi Hoa hậu Bỉ 2016.
•  Bolivia – Paula Schneider được trao danh hiệu "Hoa hậu Hoàn vũ Bolivia 2015" và có quyền tham dự cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ 2016; tuy nhiên, Schneider đã từ chức vào tháng 1 năm 2016 vì lý do cá nhân. Antonella Moscatelli, Hoa hậu Hoàn vũ Bolivia 2016 đã thay thế Schneider làm đại diện của Bolivia tại cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ 2016[47].
•  Kazakhstan – Darina Kulsitova được tổ chức Hoa hậu Kazakhstan chỉ định tham gia Hoa hậu Hoàn vũ 2016 sau khi Hoa hậu Kazakhstan 2015 Regina Valter đã bị truất quyền thi đấu vì đã kết hôn. Thông báo được đưa ra một ngày trước khi các thí sinh chính thức bắt đầu đến Philippines. Darina trước đây đã thi đấu tại cuộc thi quốc gia Hoa hậu Kazakhstan 2014.
•  Hàn Quốc – Jenny Kim được chỉ định để tham dự Hoa hậu Hoàn vũ 2016 bởi Park Jeong-ah, giám đốc quốc gia của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Hàn Quốc và cũng là chủ sở hữu nhượng quyền thương hiệu mới cho Hoa hậu Hoàn vũ tại Hàn Quốc. Kim đã thay thế cho Min-ji Lee là Hoa hậu Hàn Quốc 2015, người sẽ không tham dự cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ năm 2016 sau khi Hanju E & M, tổ chức cuộc thi Hoa hậu Hàn Quốc, đã đánh mất quyền thương hiệu Hoa hậu Hoàn vũ. Park Jeong-ah cũng là chủ sở hữu cuộc thi Hoa hậu Thế giới tại Hàn Quốc và Kim là Á hậu 1 trong cuộc thi Hoa hậu Thế giới Hàn Quốc 2015.
•  Mauritius – Kushboo Ramnawaj được chọn và chỉ định tham gia Hoa hậu Hoàn vũ 2016 bởi Nevin Rupear, giám đốc quốc gia của Tổ chức Estrella Mauritius sau khi ông được bổ nhiệm làm chủ tịch nhượng quyền mới cho Hoa hậu Hoàn vũ ở Mauritius. Ramnawaj thay thế Danika Atchia, Hoa hậu Mauritius 2015, người đã được trao danh hiệu bởi chủ sở hữu nhượng quyền trước đó là Primerose Obeegadoo và sẽ đại diện cho Mauritius tại Hoa hậu Hoàn vũ 2016. Ramnawaj đã đăng quang Hoa hậu Mauritius 2014 và dự kiến ​​sẽ tham dự cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ năm 2015 nhưng đã bị thay thế bởi vì bất đồng ý kiến với chủ sở hữu nhượng quyền thương hiệu cũ[48].
•  Puerto Rico – Brenda Jimenez được trao danh hiệu "Hoa hậu Hoàn vũ Puerto Rico 2016" bởi Desiree Lowry, giám đốc quốc gia của cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ Puerto Rico, sau khi Kristhielee Caride, người chiến thắng ban đầu, đã bị truất ngôi vì hành vi có thái độ không tốt của cô[49]. Jiménez đại diện cho thành phố Aguadilla tại Hoa hậu Hoàn vũ Puerto Rico 2016 và là Á hậu 1 tại cuộc thi này.
•  Nga – Yuliana Korolkova được chỉ định là "Hoa hậu Hoàn vũ Nga 2016" để thay thế cho Yana Dobrovolskaya, người chiến thắng trong cuộc thi Hoa hậu Nga 2016. Yana Dobrovolskaya chỉ tham gia Hoa hậu Thế giới 2016 do lịch tổ chức bị trùng nhau của hai cuộc thi quốc tế. Thông thường, người chiến thắng cuộc thi Hoa hậu Nga thường tham dự cả cuộc thi Hoa hậu Hoàn vũ và Hoa hậu Thế giới. Korolkova đại diện cho Orenburg Oblast tại Hoa hậu Nga 2016 và là Á hậu 1 tại cuộc thi[50].

Bỏ cuộc

•  El Salvador,  Hy Lạp và  Ireland – Không có cuộc thi quốc gia nào được tổ chức và cũng không có chỉ định thí sinh tham dự thay thế.
•  Gabon – Không có cuộc thi quốc gia nào được tổ chức do tình trạng rối loạn chính trị và bất ổn ở đất nước này sau cuộc bầu cử tổng thống.
•  Ghana – Không có cuộc thi quốc gia nào được tổ chức sau khi RAC (Roberta Annan Consulting), chủ sở hữu nhượng quyền thương hiệu Hoa hậu Hoàn vũ trước đây ở Ghana đã kết thúc hợp đồng kí kết với tổ chức Hoa hậu Hoàn vũ[51].
•  Lebanon – Không có cuộc thi quốc gia nào được tổ chức do sự thay đổi quyền sở hữu nhượng quyền thương mại.
•  Montenegro và  Serbia – Mặc dù ban đầu được xác nhận tham gia nhưng thí sinh được chọn tham gia đã được gỡ bỏ khỏi danh sách chính thức trên trang web của Hoa hậu Hoàn vũ. Cả Montenegro và Serbia đều có cùng một chủ sở hữu nhượng quyền thương hiệu.